Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC113Q9H0I3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC113Q9H0I3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms