Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN2Q9H000 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN2Q9H000 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN2Q9H000 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms