Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA10Q9GZZ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA10Q9GZZ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA10Q9GZZ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA10Q9GZZ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA10Q9GZZ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA10Q9GZZ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA10Q9GZZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
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