Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMCQ9BYG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMCQ9BYG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms