Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC8Q9BY41 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC8Q9BY41 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC8Q9BY41 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms