Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFJQ9BTM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2AFJQ9BTM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms