Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS4Q9BT78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS4Q9BT78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS4Q9BT78 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms