Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMM29Q9BSF4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM29Q9BSF4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM29Q9BSF4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms