Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN18Q99952 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN18Q99952 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN18Q99952 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN18Q99952 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.4 ms