Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRX2Q99811 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRX2Q99811 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRX2Q99811 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms