Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3R4Q99570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3R4Q99570 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3R4Q99570 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3R4Q99570 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIK3R4Q99570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms