Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP88Q99567 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP88Q99567 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP88Q99567 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP88Q99567 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms