Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RMDN3Q96TC7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN3Q96TC7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RMDN3Q96TC7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN3Q96TC7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RMDN3Q96TC7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms