Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK5RAP2Q96SN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK5RAP2Q96SN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK5RAP2Q96SN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK5RAP2Q96SN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms