Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNAQ96QF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNAQ96QF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNAQ96QF7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNAQ96QF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms