Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM47Q96LD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM47Q96LD4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM47Q96LD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.3 ms