Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC41A2Q96JW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC41A2Q96JW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A2Q96JW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC41A2Q96JW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms