Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46AQ96IP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46AQ96IP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46AQ96IP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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