Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDXPQ96GD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDXPQ96GD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDXPQ96GD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDXPQ96GD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDXPQ96GD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms