Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VWCEQ96DN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWCEQ96DN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWCEQ96DN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWCEQ96DN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWCEQ96DN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms