Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP3Q96CW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBGCP3Q96CW5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP3Q96CW5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms