Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf49Q96BT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf49Q96BT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf49Q96BT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms