Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC74AQ96AQ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC74AQ96AQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC74AQ96AQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC74AQ96AQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC74AQ96AQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC74AQ96AQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC74AQ96AQ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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