Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM52Q96A61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TRIM52Q96A61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM52Q96A61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM52Q96A61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM52Q96A61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms