Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TAF4BQ92750 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF4BQ92750 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF4BQ92750 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms