Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRUQ92729 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRUQ92729 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRUQ92729 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRUQ92729 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRUQ92729 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRUQ92729 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms