Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM1Q92611 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM1Q92611 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM1Q92611 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms