Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf40Q8WZ69 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf40Q8WZ69 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf40Q8WZ69 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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