Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY07

SLC7A3, Cationic amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A3Q8WY07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC7A3Q8WY07 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC7A3Q8WY07 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A3Q8WY07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A3Q8WY07 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms