Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMO7Q8WWI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMO7Q8WWI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMO7Q8WWI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms