Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVZ7

RNF133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF133Q8WVZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF133Q8WVZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF133Q8WVZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF133Q8WVZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF133Q8WVZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms