Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB2BQ8WUD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB2BQ8WUD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms