Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD1Q8TEB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD1Q8TEB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms