Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms