Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL2Q8NEU8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APPL2Q8NEU8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL2Q8NEU8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APPL2Q8NEU8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APPL2Q8NEU8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms