Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C3Q8NEB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C3Q8NEB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3C3Q8NEB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3C3Q8NEB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3C3Q8NEB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.8 ms