Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C17orf53Q8N3J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C17orf53Q8N3J3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C17orf53Q8N3J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C17orf53Q8N3J3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms