Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PQLC1Q8N2U9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PQLC1Q8N2U9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PQLC1Q8N2U9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PQLC1Q8N2U9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PQLC1Q8N2U9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms