Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC2Q8IXK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC2Q8IXK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC2Q8IXK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHC2Q8IXK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC2Q8IXK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC2Q8IXK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHC2Q8IXK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms