Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP7Q86V35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP7Q86V35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP7Q86V35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP7Q86V35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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