Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM135Q86UB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM135Q86UB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM135Q86UB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms