Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PBRM1Q86U86 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PBRM1Q86U86 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PBRM1Q86U86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PBRM1Q86U86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms