Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMS2Q7Z4I7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMS2Q7Z4I7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMS2Q7Z4I7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMS2Q7Z4I7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms