Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF550Q7Z398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF550Q7Z398 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms