Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMIM5Q71RC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM5Q71RC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMIM5Q71RC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM5Q71RC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms