Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2R2Q712K3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2R2Q712K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE2R2Q712K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2R2Q712K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms