Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPGS1Q6ZTW0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPGS1Q6ZTW0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPGS1Q6ZTW0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPGS1Q6ZTW0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms