Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRFN4Q6PJG9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN4Q6PJG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN4Q6PJG9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN4Q6PJG9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms