Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC27A1Q6PCB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A1Q6PCB7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A1Q6PCB7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms