Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL13AP3Q6NVV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL13AP3Q6NVV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL13AP3Q6NVV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms